公司仅支付一半工资的处理可能受以下2点特殊情况影响：1.公司经营困难协商减薪：若公司因疫情、行业衰退等原因经营困难，与员工书面协商一致暂时支付一半工资（如约定3个月后补发差额），则该行为不违法，员工需按协商内容执行，不可直接主张全额工资；2.员工严重违纪扣减工资：若员工因故意或重大过失给公司造成经济损失，公司依据合法有效的规章制度扣减工资，且扣减后工资不低于当地最低工资标准（如当地最低工资2000元，员工工资5000元，扣减2500元后实发2500元），则扣减行为合法，员工无权要求补发差额；3.代扣法定费用：若公司从工资中代扣个人所得税、社保个人部分等法定费用，导致实发工资为约定工资的一半（如约定工资1万元，代扣个税、社保共5000元），则属于合法行为，员工需确认代扣金额是否符合法定标准。
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公司仅支付一半工资可能存在以下2点法律风险：1.诉讼时效风险：若员工未在知道公司仅支付一半工资之日起1年内申请劳动仲裁，可能因超过时效无法获得法律支持。例如：员工2023年1月发现工资仅发一半，2024年2月才申请仲裁，仲裁委可能以超过时效为由驳回申请；2.证据链断裂风险：若员工未保存劳动合同或工资支付记录，无法证明约定工资标准，可能导致仲裁或诉讼失败。例如：员工主张公司应发1万元月，但仅能提供银行流水显示实发5000元，无劳动合同证明约定工资，可能无法获得差额支持。
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针对公司仅支付一半工资的问题，以下是2点常见错误操作：1.未及时固定证据：部分员工发现工资仅发一半后，未保存劳动合同、工资条等关键证据，导致后续维权时无法证明工资标准和克扣事实，难以主张权益；2.直接旷工或拒绝工作：员工因不满工资支付问题直接旷工，可能被公司以“严重违纪”为由解除劳动合同，反而丧失维权优势；3.超过仲裁时效：劳动争议仲裁时效为1年，若员工未在知道权益被侵害后1年内申请仲裁，可能丧失胜诉权。若您已出现类似错误，建议尽快咨询律师，弥补证据或时效上的不足。
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针对“公司仅支付一半工资是否合法”的直接回复，其核心法律依据是《中华人民共和国劳动法》第五十条及《工资支付暂行规定》第十五条。《中华人民共和国劳动法》第五十条明确规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”若公司在无合法理由的情况下仅支付一半工资，直接违反该条款，属于“克扣工资”的违法行为。同时，《工资支付暂行规定》第十五条限定了用人单位可代扣工资的情形（如代扣个税、社保、法院判决的抚养费等），若公司扣除工资的理由不在此列，或未与员工协商一致，均不符合法律规定。因此，公司仅支付一半工资的行为，除非符合法定扣减情形或协商一致，否则不合法。

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